Comme pour le riz, la transformation du fonio nécessite la succession de 2 opérations :
Des essais réalisés en laboratoire au Cirad de Montpellier sur différentes variétés de fonio de Guinée à 11%-12% d'humidité ont montré que les balles et le son représentaient respectivement 23 % et 9% du poids du grain paddy. Le rendement potentiel de transformation du fonio paddy en fonio blanchi devrait théoriquement approcher 68%.
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